Uśpiony przez tysiące lat, Apocalypse - pierwszy na świecie i zarazem najpotężniejszy mutant - przebudził się, by odkryć, że światem rządzą ludzie. Chcąc „oczyścić” Ziemię pozbywając się całego rodzaju ludzkiego, zbiera grupę mutantów mających stworzyć nowy porządek. Pragnąc za wszelką cenę uratować ludzkość, Profesor X (McAvoy) staje na czele młodych X-Menów, by stoczyć zapierającą dech batalię z niepowstrzymanym, potężnym wrogiem. A stawka jest niezwykle wysoka, rezultat tej walki zdeterminuje, bowiem przyszłość całego świata.