Przedstawiciele agencji Monarch muszą zmierzyć się z grupą potworów o gigantycznych rozmiarach. Potężna Godzilla staje do walki z Mothrą, Rodanem i swoim najgroźniejszym wrogiem – trzygłowym Królem Ghidorahem. Kiedy olbrzymi przedstawiciele gatunków, o których istnieniu dawno zapomniano, nagle powstają, rozpoczyna się walka o dominację, co stawia przyszłość ludzkości pod ogromnym znakiem zapytania.